服务简介
DIA(Data-independent acquisition,数据非依赖性采集)技术是苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold团队研发的一项全新的质谱采集模式技术(也称为SWATH),基于此技术衍生出的蛋白组学简称为DIA蛋白组。数据非依赖性扫描模式是将质谱整个全扫描范围分为若干个小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描再进行二级MS/MS分析,从而降低样本检测的缺失值,同时提高定量准确性和重复性,实现大样本队列中高稳定,高精准的蛋白质组定量分析。 三黍生物采用Thermo公司 Orbitrap Exploris 480高分辨质谱系统,,集质谱系统的高分辨、准确质量数稳定性、高灵敏度和高速度扫描特点于一身,推出DIA定量蛋白组分析服务。
应用领域
植物生长发育机制研究
植物逆境胁迫机制研究
植物转录调控研究
技术路线
研磨称量
蛋白抽提
酶解纯化
上机测试
搜库对比
数据分析
报告出具
技术优势
全扫描:采集所有的离子信息,包括低丰度蛋白和肽段
超高定量准确度高:定量准确性接近SRM/MRM靶向技术
高通量:缺省值CV低,有效蛋白数据量更高
可溯源:不同批次数据整合分析和回溯性
样本要求
1、样品类型
植物组织;微生物(细菌或真菌);液体类(根系分泌液等);
2、生物学重复
建议3次及以上生物学重复;
3、样品需求量
植物组织≥200mg;微生物(细菌或真菌)≥200mg;液体类≥2.5ml;特殊情况请与公司联系;
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南;
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可;
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息;
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果
参考文献
1) Advancing Urinary Protein Biomarker Discovery by Data-independent Acquisition on a Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer.
2) Multi-laboratory assessment of reproducibility, qualitative and quantitative performance of SWATH-mass spectrometry.
3) Data-Independent Acquisition-Based Proteome and Phosphoproteome Profiling Reveals Early Protein Phosphorylation and Dephosphorylation Events in Seedlings upon Cold Exposure.