服务简介
植物基因组De novo测序分析也叫从头测序分析，指不依赖于任何参考序列信息就可对某动植物进行测序分析，使用最新的生物信息学方法进行序列拼接获得某物种的基因组序列图谱，并进行基因组结构注释、功能注释、比较基因组学分析等一系列的后续分析。基因组测序不仅可以获得该物种的全基因组序列图谱，同时也为后续物种起源进化及特定环境适应性的研究奠定了基础。三代测序技术（以PacBio和Nanopore为代表）具有读长长的特点，近几年在动植物基因组De novo中初露锋芒，已延用至今。该类型测序分析结果可以广泛应用于农林鱼牧医药及海洋等各个方面的研究。
应用领域
全基因组范围内多性状定位
品质形成分子机制研究
新物种、品种基因组测序
技术路线
研磨称量
代谢物抽提
文库构建
上机测序
数据解析
报告出具
技术优势
设备先进，三代测序平台（PacBio/Nanopore测序平台）
技术先进，Hi-C染色质构象捕获技术
样本要求
1、样品类型
植物组织；细胞；微生物（细菌或真菌）；
2、生物学重复
一般单次重复；
3、样品需求量
植物组织≥500mg；微生物（细菌/真菌）≥500mg；
4、样品准备
样本准备基本原则有：代表性 原则；迅速性原则；分装备份原则；污染控制原则；低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南；
5、保存和运输
样本用液氮速冻，-80度保存或者直接干冰寄送即可；
6、样品标记要求
样品标记清晰，尽量使用英文和数字组合，字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息；
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表，表格信息不全会对后期项目进行产生诸多影响，请填写后务必随样品一起邮寄。
结果示例
部分分析结果示例
参考文献
1) Genome-Wide Population Structure Analyses of Three Minor Millets: Kodo Millet, Little Millet, and Proso Millet.
2) Genome-wide association study reveals new genes involved in leaf trichome formation in polyploid oilseed rape (Brassica napus L.).
3) Genome-Wide Association Study of a Worldwide Collection of Wheat Genotypes Reveals Novel Quantitative Trait Loci for Leaf Rust Resistance.
4) Whole-genome sequencing of the snub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history.