服务简介
宏基因组学(Metagenomics)是由Handelsman等在1998年提出的,可以把微生物群体的所有基因组当成一个单一的基因组去处理。Kevin等对宏基因组学进行了定义,即“无需对微生物个体进行分离培养,直接应用基因组学技术对自然环境中的微生物群落进行研究”的学科。它规避了对样品中的微生物进行分离培养,提供了对无法分离培养的微生物进行研究的途径,避免了实验过程中由环境改变引起的微生物序列变化所带来的偏差。利用新一代测序技术(NGS)研究 Metagenomics,能快速准确的得到大量生物数据和丰富的微生物研究信息,从而成为研究微生物多样性和群落特征的重要手段。
应用领域
环境科学研究
食品科学研究
植物-土壤互作研究
土壤科学研究
技术路线
研磨称量
RNA抽提
文库构建
上机测序
数据解析
报告出具
样本要求
1、样品类型
土壤;堆肥;环境水样;发酵液等富含微生物的液体等;
2、生物学重复
建议6次及以上生物学重复;
3、样品需求量
土壤≥1g;发酵液等≥2ml;具体情况请与公司联系;
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性 原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南;
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可;
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息;
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果
参考文献
1) Unveiling Endophytic Bacterial Community Structures of Different Rice Cultivars Grown in a Cadmium-Contaminated Paddy Field.
2) Effects of High Forage/Concentrate Diet on Volatile Fatty Acid Production and the Microorganisms Involved in VFA Production in Cow Rumen
3) Microbial co-occurrence complicates associations of gut microbiome with US immigration, dietary intake and obesity.