服务简介
扩增子测序就是通过对基因组目的区域进行PCR扩增,将目标区域DNA扩增富集后 进行高通量测序,然后将得到的序列与特定数据库比对,确认物种,进行生物信息分析的研究策略。目前扩增子测序服务主要包括细菌16S rDNA区/真菌ITS区/真菌18S rDNA区,可有效研究特定环境中的物种信息,如对土壤,水体,口腔,粪便,瘤胃,淤泥等复杂环境中的菌群结构和丰度进行研究。
应用领域
环境科学研究
食品科学研究
肠道微生物研究
技术路线
研磨称量
RNA抽提
文库构建
上机测序
数据解析
报告出具
样本要求
1、样品类型
土壤;堆肥;环境水样;发酵液等富含微生物的液体等;
2、生物学重复
建议6次及以上生物学重复;
3、样品需求量
土壤≥1g;发酵液等≥2ml;具体情况请与公司联系;
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性 原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南;
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可;
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息;
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果
参考文献
1) Microbiome of Field Grown Hemp Reveals Potential Microbial Interactions With Root and Rhizosphere Soil.
2) Plasmodiophora brassicae Two New Biocontrol Agents Against Clubroot Caused by .
3) Meloidogyne chitwoodiShifts in the Active Rhizobiome Paralleling Low Densities in Fields Under Prolonged Organic Soil Management.