服务简介
标记蛋白质组学目前主要是iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术,分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术,采用不同数量同位素标签(iTRAQ 4/8标,TMT 6/10/16),通过特异性标记多肽的氨基酸基团,一次上机可实现最多15个不同样本中蛋白质的相对定量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。三黍生物公司采用Thermo Fisher的Q Exactive /Q Exactive Plus/Q Exactive HF质谱平台结合Nano-LC,推出基于标记定量蛋白组分析技术服务。
应用领域
植物生长发育机制研究
植物逆境胁迫机制研究
植物转录调控研究
技术路线
研磨称量
蛋白抽提
酶解纯化
上机测试
搜库对比
数据分析
报告出具
技术优势
高平行性:同一批次样本统一处理实验平行性较高
高准确性:借助于标签检测,灵敏度好以及定量准确性高
高通量:结合分级处理大大提高蛋白鉴定深度
样本要求
1、样品类型
植物组织;微生物(细菌或真菌);液体类(根系分泌液等);
2、生物学重复
建议3次及以上生物学重复;
3、样品需求量
植物组织≥200mg;微生物(细菌或真菌)≥200mg;液体类≥2.5ml;特殊情况请与公司联系;
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南;
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可;
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息;
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果
参考文献
1) Relative Protein Quantification Using Tandem Mass Tag Mass Spectrometry.
2) Simultaneous analysis of relative protein expression levels across multiple samples using iTRAQ isobaric tags with 2D nano LC–MS/MS.
3) MdMYB6 regulates anthocyanin formation in apple both through direct inhibition of the biosynthesis pathway and through substrate removal.
4) Quantitative Proteomic Analyses Identify STO/BBX24-Related Proteins Induced by UV-B.