服务简介
DIA(Data-independent acquisition,数据非依赖性采集)技术是苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold团队研发的一项全新的质谱采集模式技术(也称为SWATH),基于此技术衍生出的蛋白组学简称为DIA蛋白组。数据非依赖性扫描模式是将质谱整个全扫描范围分为若干个小窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描再进行二级MS/MS分析,从而降低样本检测的缺失值,同时提高定量准确性和重复性,实现大样本队列中高稳定,高精准的蛋白质组定量分析。 三黍生物采用Thermo公司 Orbitrap Exploris 480高分辨质谱系统,,集质谱系统的高分辨、准确质量数稳定性、高灵敏度和高速度扫描特点于一身,推出DIA定量蛋白组分析服务。
应用领域
生长发育机制研究
疾病发生机制研究
药理学机制研究
生物标志物研究
疾病分子分型
技术路线
研磨称量
蛋白抽提
酶解纯化
上机检测
搜库比对
数据分析
出具报告
DIA蛋白组专为大样本数量分析而设计,技术优势主要有:
全扫描:采集所有的离子信息,包括低丰度蛋白和肽段
超高定量准确度高:定量准确性接近SRM/MRM靶向技术
高通量:缺省值CV低,有效蛋白数据量更高
可追溯:不同批次数据整合分析和回溯性
样本要求
1、样品类型
动物组织;细胞;微生物(细菌/真菌);液体类(血液/尿液/脑脊液/灌洗液/关节液等)。
2、生物学重复
建议3次及以上生物学重复。
3、样品需求量
动物组织≥200mg;细胞需要≥107;微生物(细菌或真菌)≥200mg;液体类≥5ml;具体情况请于公司联系。
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南。
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可。
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息。
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果示例
参考文献
1) Advancing Urinary Protein Biomarker Discovery by Data-independent Acquisition on a Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer.
2) Multi-laboratory assessment of reproducibility, qualitative and quantitative performance of SWATH-mass spectrometry.
3) Exploring the oncoproteomic response of human prostate cancer to therapeutic radiation using data-independent acquisition (DIA) mass spectrometry.
4) Rapid mass spectrometric conversion of tissue biopsy samples into permanent quantitative digital proteome maps.