服务简介
全转录组是指特定物种、组织或细胞类型在某个时期或条件处理下,能转录出来的所有 RNA(转录本)的总和,包括 mRNA 和非编码 RNA (ncRNA)。目前所说的全转录组测序,主要针对mRNA 和三种 ncRNA,即 lncRNA、circRNA 和 miRNA 进行测序分析。全转录组测序项目需要同时构建两个测序文库,包括 rRNA 去除的链特异性文库和小 RNA 文库。
全转录组测序可全面快速的获取某一条件下组织或细胞中绝大部分转录本的定性和定量情况。与表达谱研究相比,全转录组测序会可对转录本进行更加准确的定量外,还可进行更为复杂的序列分析,如新转录本和罕见转录本发现、cSNP和 InDel鉴定、lncRNA和circRNA等,获得更为精确完整的基因表达图谱和突破性的发现,进而整合分析同一样本中的多种类型 RNA,明确这些 RNA 之间的共表达和相互作用/调控关系。
应用领域
生长发育机制研究
疾病发生机制研究
药理学机制研究
生物标志物研究
疾病分子分型研究
技术路线
研磨称量
核酸抽提
文库构建
上机测序
数据分析
报告出具
技术优势
高通量,多种类型 RNA同时检测
Illumina Novaseq 6000测序平台
专业的技术服务团队
样本要求
1、样品类型
动物组织;细胞;微生物(细菌或真菌);液体类。
2、生物学重复
建议3次及以上生物学重复。
3、样品需求量
动物组织≥500mg;细胞≥107;微生物(细菌/真菌)≥200mg;液体类≥2.5ml;特殊情况请于公司联系。
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南。
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可。
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息。
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果示例
参考文献
1) LncRNA SNHG8 is identified as a key regulator of acute myocardial infarction by RNA-seq analysis
2) A panel of platelet-associated circulating long non-coding RNAs as potential biomarkers for colorectal cancer.
3) Clinical and biological relevance of the transcriptomic-based prostate cancer metastasis subtypes MetA-C.