服务简介
转录组是特定物种、组织或细胞类型在某个时期或条件处理下,转录的所有 RNA(转录本)的集合,包括 mRNA 和非编码RNA。目前所说的转录组测序,即对所有的 mRNA进行测序分析,是基因结构和功能研究的基础。基于新一代高通量测序技术的转录组测序,已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。利用高通量测序技术全面快速得到已知基因表达丰度变化,新转录本和罕见转录本发现,同时还可以通过测定的序列信息精确地分析转录本的 SNP/InDel(编码序列单核苷酸多态性/插入缺失)、可变剪接、融合基因等序列及结构变异。另外,通过增加测序数据量,转录组测序对于检测低丰度转录本和发现新转录本(进而预测新的基因)也具有其独特的优势。
应用领域
生长发育机制研究
逆境胁迫机制研究
转录调控研究
技术路线
研磨称量
RNA抽提
文库构建
上机测序
数据解析
报告出具
技术优势
通量,覆盖物种编码基因70%甚至更高
Illumina Novaseq 6000测序平台覆盖更广泛
专业的技术服务团队
样本要求
1、样品类型
植物组织,细胞,微生物(细菌/真菌)和液体类;
2、生物学重复
建议3次及以上生物学重复;
3、样品需求量
植物组织≥200mg、细胞≥107、微生物(细菌/真菌)≥200mg、液体类≥2.5ml,特殊情况请与公司联系;
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性原则、迅速性原则、分装备份原则、污染控制原则、低温原则,公司可提供详细的样本准备和运输指南;
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可;
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好,同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息;
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,表格信息不全会对后期项目进行产生诸多影响,请填写后务必随样品一起邮寄。
结果示例
部分分析结果
参考文献
1) Genome-Wide Population Structure Analyses of Three Minor Millets: Kodo Millet, Little Millet, and Proso Millet.
2) Genome-wide association study reveals new genes involved in leaf trichome formation in polyploid oilseed rape (Brassica napus L.).
3) Genome-Wide Association Study of a Worldwide Collection of Wheat Genotypes Reveals Novel Quantitative Trait Loci for Leaf Rust Resistance.
4) Whole-genome sequencing of the snub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history.