服务简介
转录组是特定物种、组织或细胞类型在某个时期或条件处理下,转录的所有 RNA(转录本)的集合,包括 mRNA 和非编码 RNA。目前所说的转录组测序,即对所有的 mRNA进行测序分析,是基因结构和功能研究的基础。基于新一代高通量测序技术的转录组测序,已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。利用高通量测序技术全面快速得到已知基因表达丰度变化,新转录本和罕见转录本发现,同时还可以通过测定的序列信息精确地分析转录本的 SNP/InDel(编码序列单核苷酸多态性/插入缺失)、可变剪接、融合基因等序列及结构变异。另外,通过增加测序数据量,转录组测序对于检测低丰度转录本和发现新转录本(进而预测新的基因)也具有其独特的优势。
转录组项目RNA-seq的实验部分流程主要包括:样品的质量检测, 双链cDNA的合成, 转录组文库的构建与质检, 样本的上机测序以及生信分析等。
应用领域
生长发育机制研究
疾病发生机制研究
药理学机制研究
技术路线
研磨称量
核酸抽提
文库构建
上机测序
数据分析
报告出具
技术优势
高通量,覆盖物种编码基因70%甚至更高
Illumina Novaseq 6000测序平台覆盖更广泛
专业的技术服务团队
样本要求
1、样品类型
动物组织;细胞;微生物(细菌或真菌);液体类。
2、生物学重复
建议3次及以上生物学重复。
3、样品需求量
动物组织≥200mg;细胞≥107;微生物(细菌/真菌)≥200mg;液体类≥2.5ml;特殊情况请于公司联系。
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南。
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可。
6、样品标记
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息。
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果示例
参考文献
1) Transcriptome Analysis Reveals Downregulation of Urocortin Expression in the Hypothalamo-Neurohypophysial System of Spontaneously Hypertensive Rats.
2) Identification of Immune-Related Therapeutically Relevant Biomarkers in Breast Cancer and Breast Cancer Stem Cells by Transcriptome-Wide Analysis: A Clinical Prospective Study.
3) Iron-Deficiency Anemia Results in Transcriptional and Metabolic Remodeling in the Heart Toward a Glycolytic Phenotype.