服务简介
扩增子测序就是通过对基因组目的区域进行PCR扩增,将目标区域DNA扩增富集后 进行高通量测序,然后将得到的序列与特定数据库比对,确认物种,进行生物信息分析的研究策略。目前扩增子测序服务主要包括细菌16S rDNA区/真菌ITS区/真菌18S rDNA区,可有效研究特定环境中的物种信息,如对土壤,水体,口腔,粪便,瘤胃,淤泥等复杂环境中的菌群结构和丰度进行研究。
应用领域
肠道菌群研究
肠道代谢研究
X-肠轴疾病机制研究
技术路线
研磨称量
核酸抽提
文库构建
上机测序
数据分析
报告出具
技术优势
高通量
Illumina Novaseq 6000测序平台
专业的技术服务团队
样本要求
1、样品类型
动物组织;细胞;微生物(细菌或真菌);液体类。
2、生物学重复
建议3次以上生物学重复。
3、样品需求量
动物组织≥200mg;细胞≥107;微生物(细菌/真菌)≥200mg;液体类≥2.5ml;特殊情况请于公司联系。
4、样品准备
样本准备基本原则有:代表性原则;迅速性原则;分装备份原则;污染控制原则;低温原则。公司可提供详细的样本准备和运输指南。
5、保存和运输
样本用液氮速冻,-80度保存或者直接干冰寄送即可。
6、样品标记要求
样品标记清晰,尽量使用英文和数字组合,字符数在15个以内为好。同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息。
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表,务必随样品一起邮寄,由于表格信息不全造成的损失由客户自行承担。
结果示例
部分分析结果示例
参考文献
1) Proof-of-principle demonstration of endogenous circadian system and circadian misalignment effects on human oral microbiota.
2) High-throughput 16S rDNA sequencing of the pulmonary microbiome of rats with allergic asthma.
3) Altered microbial community structure and metabolism in cow's milk allergic mice treated with oral immunotherapy and fructo-oligosaccharides.