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不让技术成为科研的障碍

2024.03.01

十年三黍 | 文章篇:感恩同行 致敬经典

十年风雨坎坷,

十年传承跨越,

十年并肩携手前进。

感谢这十年里一直支持、信任三黍生物的伙伴们,

我们整理了三黍十年来部分经典合作文章,

致敬科研,致敬经典,致敬新老客户!

(以下文献合集可在后台回复关键词“三黍生物”,获得下载链接)


01 多组学系列

题目:根系菌落重建

发表杂志:Microbiome

影响因子:10.47

摘要:

压力诱导激素对于植物调节微生物群和动态适应环境至关重要。尽管植物激素乙烯在植物对异特异性邻居检测的生理反应中的作用受到重视,但人们对这一激活信号如何介导焦点植物根瘤微生物群以提高植物适应性的了解较少。在这里,除了外源乙烯施用和土壤培养实验外,我们还利用 3 年的豆科植物花生(Arachis hypogaea L.)和含氰化物木薯(Manihot esculenta Crantz)间作和花生单作田间、盆栽和水培实验,发现乙烯(一种氰化物衍生信号)与邻近木薯的化学鉴定和花生根圈微生物的重新组合有关。

点击阅读:客户文章| Microbiome:木薯花生间作重建根际微生物群落


题目:艾草黄酮提取物的抗氧化和抗炎药效活性机制研究

发表杂志:Food Chemistry

影响因子:9.13

摘要:

本研究成功地从青蒿茎中提取了黄酮类化合物,其产量达到15.3毫克/克干青蒿茎。蒿茎黄酮提取物的纯度为 88.58 %(重量比),同时还分别含有 1.57 %(重量比)碳水化合物、2.04 %(重量比)蛋白质和 7.81 %(重量比)多酚。体外抗氧化活性分析表明,箭毒茎黄酮提取物对 1,1-二苯基-2-苦基肼、2,2′-偶氮二-二(3-乙基-苯并噻唑啉-6-磺酸)二铵盐、羟基和超氧自由基的清除作用呈浓度依赖性。此外,A. argyi 茎的黄酮类提取物通过抑制肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-6、白细胞介素-1β和一氧化氮自由基的水平,对脂多糖刺激的 RAW 264.7 巨噬细胞具有保护作用。总之,这项工作将为利用可食用的箭毒作为植物性膳食及其生物活性黄酮提取物作为抗氧化和抗炎成分,以改善食品的功能、营养和健康提供指导和帮助。

点击阅读:一作解读|FC.艾草秸秆黄酮的体外抗氧化活性及其对脂多糖刺激的巨噬细胞264.7的抗炎保护作用


题目:鹅掌楸碱通过肠道微生物介导保护子宫内膜炎的分子机制研究

发表杂志:

International Immunopharmacology

影响因子:5.5

摘要:

慢性子宫内膜炎(CE)是一种以炎症为特征的妇科疾病。据报道,鹅掌楸碱具有抗炎特性。然而,鹅掌楸碱对慢性子宫内膜炎的治疗作用及其潜在的分子机制尚未阐明。本研究旨在探讨鹅掌楸碱对大鼠 CE 的治疗作用及其机制。

建立 CE 大鼠模型,并给予 21 天的利碘腺嘌呤。使用酶联免疫吸附试验检测血清中炎性细胞因子的水平。使用实时聚合酶链反应定量分析法检测了子宫细胞因子的 mRNA 水平。采用 Western 印迹分析法研究了 Toll 样受体 4 (TLR4)/NF-κB 通路的激活情况。利用 16S rRNA 测序和非靶向血清代谢组学分别研究了利碘腺嘌呤对肠道菌群和血清代谢物的影响。评估了精氨酸酶-2(Arg-2)和一氧化氮(NO)代谢途径相关因子的蛋白和 mRNA 水平。进行了分子对接,以探讨鹅掌楸碱与 Arg-2 之间的相互作用。


题目:代谢组揭示碱胁迫对糜子营养品质的影响机制

发表杂志:Food Research International

影响因子:7.425

摘要:

帚角小米(BM)是一种未来的智能食品。然而,目前还没有关于碱性胁迫下 BM 谷物新陈代谢的信息。本研究通过代谢组学方法研究了碱性胁迫对两个品种(S223 和 T289)粟谷粒中非挥发性和挥发性代谢物的影响。结果表明,在正常胁迫和碱性胁迫下,S223 和 T289 谷粒中的非挥发性代谢物和挥发性代谢物分别有 114 和 89 种和 16 和 20 种不同程度的积累。结果表明,碱性胁迫改变了苯丙酮类、黄酮类、黄酮和黄酮醇、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成,以及精氨酸、脯氨酸、色氨酸和抗坏血酸的代谢。碱性胁迫对两个品种的影响不尽相同,这可能导致活性物质含量的差异。这些结果为进一步研究 BM 谷物的食品化学和功能食品开发提供了有价值的信息。


题目:玉米ZmBES1BZR1-1转录因子负调控抗旱性

发表杂志:

Plant Physiology and Biochemistry

影响因子:6.5

摘要:

干旱胁迫是一种常见的非生物因素,会限制植物的生长和发育。探索玉米胁迫相关基因及其调控机制对于确保农业生产力和粮食安全至关重要。BRI1-EMS1 抑制因子(BES1)/抗重氮唑 1(BZR1)转录因子(TFs)在植物生长、发育和胁迫响应中发挥着重要作用。然而,玉米 ZmBES1/BZR1 的报道却很少。本研究从玉米 B73 中克隆了 ZmBES1/BZR1-1 基因,并对其在转基因拟南芥和水稻干旱胁迫响应中的功能进行了表征。ZmBES1/BZR1-1蛋白具有BES1/BZR1 TFs所特有的保守bHLH结构域,定位于细胞核,并表现出转录激活活性。ZmBES1/BZR1-1 在玉米中的表达没有组织特异性,但具有干旱抑制性。在干旱胁迫下,ZmBES1/BZR1-1 的过表达增强了转基因拟南芥和水稻对干旱的敏感性,降低了存活率、活性氧(ROS)水平和相对含水量(RWC )以及更高的气孔孔径和相对电解质泄漏(REL)。RNA-seq结果显示,ZmBES1/BZR1-1通过与启动子中的E-box元件结合调控了56个差异表达基因(DEGs)。GO分析表明,这些DEGs与氧化应激反应和氧水平密切相关。该研究表明,ZmBES1/BZR1-1基因对干旱胁迫有负向调控作用,从而进一步揭示了BZR1/BES1s介导的干旱胁迫响应的潜在分子机制。


0 多糖系列

题目:奇异果果皮多糖的结构特征和免疫学活性多糖的结构特征和免疫活性

发表杂志:Carbohydrate Polymers

影响因子:7.2

摘要:

通过热水提取、乙醇沉淀和柱层析,从奇异果(Cucumis metuliferus)果皮中分离出两种新型多糖,即CMPP-1和CMPP-2。结果表明,CMPP-1 和 CMPP-2 属于异半乳糖醛酸,分子量分别为 7.35 kDa 和 6.90 kDa。CMPP-1和CMPP-2主要由葡萄糖醛酸(分别占45.93%和51.75%)和其他单糖组成,包括鼠李糖、阿拉伯糖、半乳糖、葡萄糖、木糖、岩藻糖、甘露糖、半乳糖醛酸和甘露糖醛酸。傅立叶变换红外光谱和核磁共振的结构表征结果证实,CMPP-1 和 CMPP-2 是具有高度支化结构的果胶。此外,CMPP-1 和 CMPP-2 都具有免疫增强活性,能以剂量依赖的方式增强一氧化氮和细胞因子(TNF-α、IL-6)的分泌。特别是,CMPP-1 的免疫活性高于 CMPP-2。CMPP-1 的最低有效浓度分别为 0.78 μg/mL 和 6.25 μg/mL。这些发现为进一步利用猕猴桃皮多糖提供了科学依据。


题目:齿瓣石斛多糖结构特征及其活性研究

发表杂志:International Journal of Biological Macromolecules

影响因子:6.8

摘要:

为探索铁皮石斛中的活性多糖,研究人员从铁皮石斛中分离出一种分子量为117 kDa的新型O-乙酰甘露聚糖(DDP-1)。化学和仪器分析表明,DDP-1是一种均聚糖,其骨架链由→4)-β-d-Manp-(1 → (71.4%)残基组成,内部含有→4)-2-O-乙酰基-β-d-Manp-(1 → (14.2%)、→4)-3-O-乙酰基-β-d-Manp-(1 → (7.1%)和非还原端β-d-Manp-(1 → (7.3%)残基。体外抗癌试验表明,DDP-1 对 HepG2 和 MCF-7 癌细胞的生长具有抗癌活性。此外,细胞因子分泌试验也表明,DDP-1 能促进受 PMA 刺激的 THP-1 巨噬细胞产生 TNF-α 和 IL-6。最后,利用扫描电子显微镜研究了分离和纯化对 DDP-1 微观结构的影响。DDP-1的形态特征表明,DDP-1在亲水性聚合物材料中具有很高的应用潜力。

点击阅读:文献解读|IJBM齿瓣石斛中新型甘露聚糖结构表征和活性研究


题目:秦岭悬钩子未成熟果实中新型多糖结构及在肠炎治疗中的活性研究

发表杂志:Food Chemistry

影响因子:9.23

摘要:

树莓被用作药食同源物种,其多糖值得研究和开发。本研究从未成熟的覆盆子果实中提取并鉴定了一种新型多糖(pRCP)。结果表明,pRCP 是一种酸性杂多糖,其 Mw 值为 74.86 kDa,具有较高的均一性。pRCP 的主链由 → 3,6)-β-Galp(1 → 和 → 5)-α-Araf(1→ 组成,其侧链由α-Araf(1→)组成。侧链由连接到 → 3,6)-β-Galp(1 → 的 C3 位置的 α-Araf(1 → 组成。此外,补充 pRCP 还能增加高脂饮食(HFD)喂养小鼠的肠道微生物多样性并减少有害细菌,包括红细胞梭状芽孢杆菌(Erysipelatoclostridium)和阴沟杆菌(Negativibacillus)。用 pRCP 治疗还能减轻高脂饮食诱导的小鼠结肠炎症和氧化应激。这些有益作用可通过粪便微生物小鼠。因此,我们的研究表明,pRCP 可作为一种潜在的益生元,通过调节肠道微生物群来改善肠道健康。


题目:核桃壳多糖的提取纯化及抗氧化活性研究

发表杂志:Food Research International

影响因子:6.6

摘要:

近年来,植物多糖的生物活性越来越受到人们的关注。雷公藤是世界四大干果之一,具有极高的营养价值和保健价值。为了更好地开发雷公藤壳多糖的营养保健功效,以雷公藤壳为原料制备雷公藤壳多糖。

为更好地开发雷公藤壳多糖的营养保健功效,本研究以雷公藤壳为原料,采用水提醇沉法制备雷公藤壳多糖。研究了其衍生物的分子量、单糖成分、分子结构特点和抗氧化活性。随后,获得了一系列对研究雷公藤壳多糖及其衍生物有意义的数据信息。多糖经 DEAE-52 和 Sephadex G-100 分离纯化后,分子量为 9.45×104 Da。多糖中含有鼠李糖、阿拉伯糖、半乳糖、葡萄糖、木糖和半乳糖醛酸,各单糖成分的摩尔比为 6.7%:16.5%: 28.3%: 11.2%: 12.5%: 24.8%. 雷公藤壳多糖分子结构中含有β-葡萄糖苷键,其结构可能为→4)-α-D-Galp-(1→4)-β-D-GalAp-(1→4)-α-D-Xylp-(1→糖苷键)。在抗氧化活性研究中,雷公藤壳多糖及其衍生物表现出良好的生物活性,尤其是磷酸化雷公藤壳多糖。雷公藤壳多糖的研究对提高雷公藤产业链的质量和效益具有重要的现实意义。


题目:球毛壳菌多糖的结构及免疫活性研究

发表杂志:Carbohydrate Polymer Technologies and Applications

影响因子:5.5

摘要:

本研究表征了球毛茶菌(Chaetomium globosum)CGMCC 6882产生的碱沉淀多糖(CGP-AP)的结构特征,并研究了其在RAW 264.7巨噬细胞中的免疫调节活性。CGP-AP 的产量为 0.93 ± 0.08 g/L,其中碳水化合物含量为 98.33% ± 2.04%(重量比),蛋白质含量为 1.52% ± 0.26%(重量比)。结构分析表明,CGP-AP 由葡萄糖(99.51%)和阿拉伯糖(0.49%)组成,重量(Mw)和数量(Mn)平均分子量分别为 0.948 和 0.55 kDa,多分散性(Mw/Mn)为 1.724。体外免疫调节结果表明,CGP-AP 通过上调 RAW 264.7 巨噬细胞中相关基因的表达水平,刺激一氧化氮的产生和肿瘤坏死因子-α、白细胞介素(IL)-1β、IL-6 和 IL-8 的分泌。同时,CGP-AP 还能上调促炎基因(诱导型一氧化氮合酶和环氧化酶-2 COX-2)的表达水平。此外,CGP-AP 还能提高抗氧化酶(超氧化物歧化酶、过氧化氢酶和谷胱甘肽过氧化物酶)的水平,增强核因子红细胞-2 相关因子 2 的 mRNA 表达,从而改善 RAW 264.7 细胞的抗氧化状态。上述结果表明,CGP-AP 可作为一种潜在的免疫调节剂用于制药业。

03 淀粉系列

题目:淀粉糊化过程中分子结构变化对其流变学和3D打印性能的影响

发表杂志:Food Hydrocolloids

影响因子:11

摘要:

尽管人们对淀粉糊化过程中分子结构的变化进行了深入研究,但淀粉糊化过程中淀粉流变特性、可印刷性与淀粉分子结构变化之间的关系仍不清楚。本研究主要关注不同处理温度下玉米淀粉(CS)凝胶分子结构的变化及其对CS凝胶流变性能和3D打印性能的影响。随着处理温度的升高,玉米淀粉的浸出直链淀粉含量和短直链(DP 6-12)含量增加,而长直链(DP > 12)含量减少,从而影响淀粉的流变学和 3D 打印性能。由于原始颗粒和结晶结构的存在,CS-65 淀粉凝胶的储存模量(G′)较低,表明其 3D 打印性能较差。淀粉的浸出诱导形成了新的晶体和交联网络结构,这有利于提高其 G′。然而,直链淀粉短线链(DP 6-12)的增加降低了短程有序度和氢键相互作用,不利于其 G′和屈服应力 (τf)。CS-80 淀粉凝胶的 G′和剪切恢复率最大,显示出最高的自承性和印刷精度。极高的温度促进了淀粉凝胶结构的致密化,从而提高了淀粉凝胶的自承性和印刷精度,从而导致 τf 增加和挤压困难。总之,淀粉糊化引起的分子结构变化对其在三维打印中的理想流变特性至关重要。


题目:一种简便的富含长线性糊精的淀粉组分分类方法

发表杂志:Food Hydrocolloids

影响因子:11.5

摘要:

对不同链长的线性糊精进行分馏对制备功能性食品具有重要意义。传统的梯度非溶剂沉淀法耗时耗力,不便进行大规模的糊精分馏。本研究旨在建立一种新方法,通过简单加热(70-80 °C)和离心分离脱颗粒淀粉溶液,从脱颗粒蜡质玉米淀粉中分馏出长线性糊精。结果表明,脱枝过程中产生的线性糊精形成了有序结构,熔点温度为 58.8-95.4 ℃。根据对淀粉热稳定性和链长分布的分析,发现有序结构的热稳定性与线性糊精的链长呈显著正相关。在 70 和 80 °C加热过程中,热稳定性较弱的有序结构在溶液中熔化,因此短线性糊精可通过离心从脱粒淀粉中去除,而热稳定性好的有序结构可通过分馏获得长线性糊精。通过这种简单的 "加热-离心 "方法,淀粉中长线性糊精的含量从 27.08% 提高到 43.40%。这项研究为长线糊精的分馏提供了一条可行的途径。


题目:氮肥通过淀粉合成对小米品质的影响

发表杂志:Carbohydrate Polymers

影响因子:10.7

摘要:

对不同链长的线性糊精进行分馏对制备功能性食品具有重要意义。传统的梯度非溶剂沉淀法耗时耗力,不便进行大规模的糊精分馏。本研究旨在建立一种新方法,通过简单加热(70-80 °C)和离心分离脱颗粒淀粉溶液,从脱颗粒蜡质玉米淀粉中分馏出长线性糊精。结果表明,脱枝过程中产生的线性糊精形成了有序结构,熔点温度为 58.8-95.4 ℃。根据对淀粉热稳定性和链长分布的分析,发现有序结构的热稳定性与线性糊精的链长呈显著正相关。在 70 和 80 °C加热过程中,热稳定性较弱的有序结构在溶液中熔化,因此短线性糊精可通过离心从脱粒淀粉中去除,而热稳定性好的有序结构可通过分馏获得长线性糊精。通过这种简单的 "加热-离心 "方法,淀粉中长线性糊精的含量从 27.08% 提高到 43.40%。这项研究为长线糊精的分馏提供了一条可行的途径。


题目:蕉芋RS3型抗性淀粉表征及其通过肠道菌群对高血脂的影响研究

发表杂志:Food Chemistry

影响因子:6.8

摘要:

3 型抗性淀粉(RS3)是由 Canna edulis(Ce)原生淀粉(NS)通过双重酶水解和重结晶。随后,对加工后的 Ce-RS3 进行了系统的表征 其结构特性、抗高血脂作用和体内肠道微生物群调节功能。在最佳条件下加工后,Ce-RS3的含量提高到49.11%。与 NS 相比 与 NS 相比,Ce-RS3 保持了其 B 型结晶,没有引入新的化学基团。同时,它显示出 同时,它显示出粗糙的表面、更高的结晶度、更有序的结构和更高比例的聚合度(DP 聚合度(DP)为 37-100 的链比例更高。Ce-RS3干预能明显缓解高脂血症小鼠的血脂异常。这与肠道微生物多样性的增加和独特的微生物富集有关,可能是由其精细结构介导的。这与肠道微生物多样性的增加和独特的微生物富集有关,可能是由其精细结构介导的。这些观察结果对于开发益生元应用中的 RS3 的潜在策略提供了支持,种群以改善健康的潜在策略。

点击阅读:客户文章|FC一作解读:蕉芋RS3型抗性淀粉表征及其通过肠道菌群对高血脂的影响研究


题目:基因编辑糯性水稻淀粉理化指标检测分析

发表杂志:Carbohydrate Polymers

影响因子:10.7

摘要:

蜡质水稻缺乏直链淀粉,是水稻的一个重要变种,其淀粉已被广泛使用。本文介绍了通过CRISPR/Cas9基因编辑系统生成的蜡质水稻新品种。本文通过CRISPR/Cas9编辑Waxy(Wx)基因,成功获得了四种不同理化性质的蜡质水稻淀粉。结果表明,Wx突变体淀粉的直链淀粉含量(AC)从0.26%到1.78%不等,而在所有Wx突变体中,CZBwx1淀粉的凝胶稠度最好,水溶性最高。Wxb等位基因突变体比Wxa等位基因突变体产生更多的短链(链聚合度(DP)6-11)和更少的中长链(DP12-70),而Wxa等位基因突变体的AC则高于Wxb等位基因突变体。wxa突变体淀粉的糊化温度(GT)高于wxb突变体淀粉。此外,我们还发现,Wx基因编辑后,蜡质水稻淀粉的GT和直链淀粉的精细结构类型没有发生变化。基于这些发现,我们有可能制备出具有不同理化性质的蜡质水稻淀粉,其中包含目标 GT 和链长分布的直链淀粉。

在未来的日子里,我们会开发更多、更优质的产品,给大家提供更方便、快捷的服务。十年不是终点,只是新的起点,希望能在以后的日子里和更多的伙伴们相遇三黍!

排版:野凌
审核:三黍生物市场部

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