本网站使用cookie。继续浏览本网站,即表示您同意我们使用cookies。有关cookies的更多细节以及如何管理它们,请参阅我们的 隐私政策

不让技术成为科研的障碍

2023.03.14

文献解读|Int. J. Cancer 蛋白质水平发现胰腺癌新的诊断标志物



SANSHUBIO
·背景·


胰腺癌(PAAC)是中国致死人数排名第六的恶性肿瘤,其恶性程度高,早期病情隐匿,超过80%的患者在就诊时已进展为晚期,错失手术切除治愈的机会,而成功接受了手术治疗的胰腺癌患者,也极易发生转移,5年生存率仅为15%~20%。因此,胰腺癌的早期诊断对于提高患者生存率至关重要。


2023年3月发表在International Journal of Cancer上的文章“Circulating tumor-associated autoantibodies as novel diagnostic biomarkers in pancreatic adenocarcinoma,纳入了338名PAAC患者,发现CLDN17联合CA19-9具有潜在的临床价值,可作为PAAC诊断的无创新型生物标志物。






研究材料



338名PAAC患者、294名正常健康志愿者(NHV)、122名慢性胰腺炎(CP)患者、100名非PAAC的恶性肿瘤患者。




实验路线







研究结果


 1、实验设计


该研究被分为鉴定、验证和评估三阶段。鉴定阶段(n=60)筛选了21,065个蛋白质,来鉴定能区分PAAC(n=30)和NHV(n=30)的候选TAAbs,差异表达的TAAbs被定义为以PAAC重点阵列,在验证(n=712)和评估(n=82)阶段采用。验证阶段包括266例PAAC样本,98例CP样本和248份NHV样本。在鉴定阶段,对100名其他恶性肿瘤患者的血清进行评估,确定区分PAAC和对照的TAAbs特征。随后建立诊断模型,并在评估阶段,通过ELISA对PAAC(n=42)、CP(n=24)和NHV(n=16)的血清样本测试该模型和TAAbs的诊断性能。


2、TAAbs的筛选与鉴定及PAAC聚焦阵列的构建


在鉴定阶段,作者找到了在PAAC组和NHV组中差异表达的165个蛋白,其中,83个TAAbs为IgG型,82个TAAbs为IgM型(图1A-B)。KEGG、GO和Reactome数据库匹配结果显示,包括先天免疫系统、翻译后蛋白修饰、细胞死亡调节、细胞凋亡过程和其他途径的多种生物途径被富集(图1C)。

图1 TAAbs的筛选和鉴定及以PAAC中心阵列的构建


3、TAAbs作为PAAC诊断生物标志物的验证


为了验证所选TAAbs是否可作为PAAC的诊断标志物, 作者使用266个PAAC、98个CP和248个NHV样本进行验证,结果显示,PAAC的TAAbs与NHV和CP的不同(图2A),随后的10倍交叉验证中(图2B),样本被随机分为训练组和测试组,作者在模型中发现了5个针对CLDN17(Claudin 17)、KCNN3(钾钙激活通道亚家族N成员3)、SLAMF7(信号淋巴细胞激活分子的自配体受体)、SLC22A11(溶质载体家族22成员11)和OR51F2(嗅觉受体家族51亚家族F成员2)的IgG型TAAbs。



图2 TAAbs作为PAAC诊断标志物的验证


这五个TAAbs在不同组别内的表达如图所示,与CP和NHV相比,CLDN17、KCNN3、SLAMF7、SLC22A11和OR51F2的TAAbs在PAAC患者的血清样本中高表达(图3A)。阳性率被确定为观察到的反应性与截止值的平均比率,也代表了TAAbs的表达水平,图3B-D中的结果显示,对照组的阳性率为4.08%至7.14%,但PAAC患者的阳性率为21.05%至48.87%。


图3 五种TAAbs在PAAC、CP、NHV中的表达及阳性率


 4、五种TAAbs的诊断价值


为了研究选定TAAbs的诊断敏感性和特异性,作者随后用ROC曲线分析了它们的诊断性能。图4A-C显示了5种TAAbs和CA19-9区分PAAC和对照组的ROC曲线。此外,尽管CA19-9是广泛用于PAAC诊断的生物标志物,但Lewis阴性者的假阴性占所有PAAC患者的15%。因此,作者还评估了CA19-9阴性PAAC的诊断性能。图4D-F为五种TAAbs检测CA19-9阴性PAAC与对照组的ROC曲线。与整个PAAC队列相似,CLDN17在检测CP的CA19-9阴性PAAC时也得到了最佳的AUC。但TAAbs的组合在区分PAAC患者和NHV及CP患者方面没有表现出优越性。


综上所述,两种TAAbs组合(组合1:CLDN17、KCNN3、SLAMF7和SLC22A11;组合2:CLDN17、KCNN3、SLC22A11和OR51F2),在鉴别PAAC患者与NHV+CP、NHV和CP方面显示出最佳的诊断性能。单个TAAb CLDN17在区分PAAC患者与NHV+CP、NHV和CP时的AUC较好。


图4 五种TAAbs的诊断价值


5、TAAbs诊断模型的单因素和多因素分析


在模型验证中,作者发现CA19-9和五种TAAbs可以显著区分PAAC和NHV(图5A)。多变量逻辑回归分析包括所有重要参数,显示CA19-9和CLDN17也可以显著区分PAAC和NHV。因此,作者建立了一个鉴别模型,且PAAC组的模型得分明显高于CP和NHV(图5B)。


鉴别模型的诊断性能显示,该模型在区分PAAC和NHV方面明显比CA19-9和CLDN17的诊断价值高(图5C)。在区分PAAC和CP方面,该模型的性能始终明显高于CA19-9和CLDN17(图5D)。同样,该模型在区分PAAC与对照组方面显示出比CA19-9和CLDN17更优越的诊断性能(图5E)。因此,该鉴别模型可能是一种更敏感、更特异的PAAC诊断方法。


作者随后使用ELISA检测了CLDN17、KCNN3、SLAMF7、SLC22A11和OR51F2的血清自身抗原水平,并确定它们在区分胰腺癌样本和对照组方面的性能。结果显示,模型在区分PAAC与对照组方面显示出比CA19-9和CLDN17更优越的诊断性能(图5F)。


图5 Logistic模型建立





总结




在这篇研究中,作者通过研究854份血清样本集的蛋白质组成,描述了PAAC中循环的TAAbs特征,发现了CLDN17联合CA19-9可作为PAAC诊断的无创新型生物标志物。此外,作者还建立了一个高精度检测PAAC的诊断模型,该模型对PAAC的早期无创检测具有潜在的临床价值,深入的机制研究和进一步的体内外验证将促进对PAAC生物学的认识。






往期推荐


|Food&Function

Front Nutr |

|Foods  Cucumis metuliferus 

|Frontiers in Nutrition.

|F.C.-

... ...




文本:牛晶晶



18

联系我们

*
*
*
*
提 交