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2023.06.02

文献解读

精品解读 | 多糖结构与活性研究范例:蛋白组与微生物组联合揭示杜仲多糖延长果蝇寿命的分子机制




SANSHUBIO

背景




植物多糖,又称植物多聚糖,是植物细胞代谢产生的聚合度超过10个的聚糖。先前的工作已经证明,植物多糖对肠道微生物群具有有益作用,特别是在降低致病菌丰度和增加有益细菌种群方面。然而,关于植物多糖对衰老过程中与年龄相关的肠道微生物群失调和ROS积累的影响的证据有限。

2023年西北农林科技大学赵善廷领衔的神经生物学团队发表在International Journal of Molecular Sciences上的题为“Eucommia Polysaccharides Ameliorate Aging-Associated Gut Dysbiosis: A Potential Mechanism for Life Extension in Drosophila”的论文,作者以杜仲为原料提取杜仲多糖,不仅对杜仲多糖进行分子量及单糖组成等结构解析,而且通过果蝇体内实验,结合Label-free蛋白质组和微生物组学(16S)揭示杜仲多糖(EPs)通过减少年龄相关ROS的累积以及改善肠道微生物群稳态进而延长果蝇寿命的分子机制,是多糖分子结构解析与多组学研究多糖活性机制两种研究思路相结合的经典佳作。






研究材料


杜仲多糖

果蝇



技术方法


多糖电镜,单糖组成,多糖分子量,运动水平观察,蛋白质组检测,微生物组检测,ROS相关酶活检测,FMT



实验路线




实验路线



1

杜仲多糖的结构研究


作者首先通过实验研究了杜仲多糖(EPs)的形态表征,结构参数包括单糖组成和分子量结果,如图1所示。结果表明杜仲多糖分子量在630-251KD,是由甘露糖,鼠李糖,葡萄糖,半乳糖,木糖,阿拉伯糖和半乳糖醛酸所组成的酸性多糖,其中葡萄糖占比高达82%。


图1 杜仲多糖的分子结构检测的



2

杜仲多糖(EPs)可以延长果蝇寿命


为了探索EPs的体内作用,作者采用不同浓度(1%,2%,4%,8%,16%)喂养黑腹果蝇,并每天计算存活率(图2A)。结果表明,低浓度组(1%)的果蝇存活率没有显著差异,但2%和4%组均显示出寿命延长,与之相对应的是,8%和16%组表现出负面影响(图2B-G)。


图2 适当浓度的EPs能够促进果蝇存活并延长其寿命



3

补充EPs可促进老年果蝇的运动活性和繁殖力


为了进行后续研究,作者评估了果蝇体重,结果显示雄果蝇(图3A)和雌果蝇(图3B)在4%浓度时体重影响最小,因此选用该浓度。运动和繁殖实验表明,EPs补充分别提高了果蝇的攀爬能力和雌果蝇的繁殖力(图3C-D) 。这些证据进一步表明,在发育过程中适当补充EPs可以延缓衰老并促进长寿。

图3 EPs对老年果蝇行为的影响



4

蛋白组揭示EPs减少老年果蝇的氧化应激


作者收集了果蝇样本进行label-free蛋白质组学检测(图4A),数据结果显示10日龄和30日龄的果蝇之间存在显著差异,而EPs喂养30日龄的果蝇更接近10日龄的蛋白数据。与10日龄相比,30日龄果蝇的Kelch样ECH相关蛋白1/核因子E2相关因子2(Keap1/Nrf2)途径相关的蛋白明显下调,而在喂食EPs的30日龄果蝇中则上调(图4C,D)。大脑和肠道组织中的ROS累积实验也表现出类似的结果,即与10日龄相比,ROS在30日龄果蝇中明显积累,但在EPs喂养的30日龄果蝇中的ROS水平有所下降(图4E-G),相对应的,SOD和GSH-Px(与ROS清除有关)的活性也在EPs喂养组中有所增加。以上结果表明EPs能够减少果蝇中与年龄相关的氧化应激。


图4 EPs抑制老年果蝇的氧化应激



5

EPs降低肠道ROS生成相关菌群的丰度


为了研究EPs在肠道微生物群中的作用,作者收集了果蝇肠道进行了微生物组16S检测,与蛋白组结果相类似,衰老造成的肠道菌群差异被EPs补充回复靠近年轻果蝇(图5A-B)。LEfSe分析结果中,与10日龄相比,30日龄果蝇中富含Gluconobacter、Providencia和Enterobacteriaceae,通过Mantel检验,证实了这些菌群的丰富度与ROS累积存在明显的正相关,且进一步的随机森林分析数据表明它们是预测果蝇中ROS积累的主要变量(图5C-E)。在EPs补充后,这三种菌的变化被显著缓解(图5F-H)。这些结果表明,EPs可以拯救果蝇由衰老造成的肠道微生物群结构变化。


图5 EPs重塑了老年果蝇的肠道微生物群



6

Eps造成的肠道微生物群变化与寿命延长之间的关系


为了确认肠道微生物群与寿命变化之间的关系,作者在蜕变后24h内收集果蝇,并将分组设置为:EPs组(果蝇被培养在补充有EPs的培养基上),抗生素组(果蝇在补充有利福霉素、四环素和氨苄青霉素的培养基上培养),EPs+抗生素组(果蝇被培养在同时补充有EPs和抗生素的培养基上),FMT-EA组(果蝇在标准培养基上培养30天,然后转移到30日龄EPs组果蝇使用过培养基上),FMT-A(果蝇在标准培养基上培养30天,然后转移到30日龄对照组果蝇使用过的培养基上)和对照组(果蝇在标准培养基上培养),每天对活体果蝇进行计数,直到最后一只果蝇死亡(图6A)。

与先前的数据一致,EPs组果蝇寿命显著增加,EPs+抗生素组只受到轻微影响,而抗生素组与对照相比无较大差异(图6B)。此外,FMT-EA组的数据表明,EPs组老年果蝇的FMT也能显著延长果蝇寿命,而对照组老年果蝇的FMT则轻度缩短了果蝇寿命(图6C)。


图6 EPs通过肠道微生物群重塑实现寿命延长



7

EPs组30日龄果蝇的FMT对肠道微生物群的影响与EPs组类似


为了确认EPs组30日龄果蝇FMT的影响是否与EPs组类似,作者进行了进一步的实验(图7A)。微生物组数据表明与FA-10(在对照组30日龄的FMT培养基上培养)的相比,FE-10(在EP组30日龄的FMT培养基上培养)的微生物群构成更接近于10日龄果蝇,而FA-10更接近于30日龄果蝇。而衰老引起的Gluconobacter、Providencia和Enterobacteriaceae的丰度变化也在FE-10中被回复(图7B-E)。

这些证据表明,EPs组30日龄果蝇的FMT对肠道微生物群的影响与EPs相似。

图7 老年果蝇FMT对幼蝇肠道微生物群的影响


SANSHUBIO
小结








在这项研究中,作者以杜仲多糖为原料,应用多糖结构检测技术,行为学监测、蛋白质组学、肠道微生物组学和生物信息学等先进的医学生物学技术方法,深入系统地研究了杜仲延年益寿的分子机制,结果表明EPs可以重塑肠道微生物组成,缓解ROS积累,并延长果蝇的寿命。此外,EPs还能有效地改善年龄引起的衰退,如运动能力和繁殖力的下降。因此,EPs在未来有希望作为益生元重塑与年龄相关微生物群,从而对衰老造成的相关功能障碍产生一定的缓解作用。


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图文排版:荷包蛋&檀檀
审核:三黍市场部



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