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2024.09.25

客户文章 | 显著提高水稻结实率!四川农业大学团队报道淀粉合成相关基因



背景介绍



抗性淀粉(RS)饮食有诸多益处,如降低致病性感染、结肠癌发病率、餐后血糖和低密度脂蛋白(LDL)血清胆固醇水平等。并且高抗性淀粉饮食在降低2型糖尿病的风险方面卓有成效。因此,一些研究侧重于通过遗传育种、生物技术和物理和化学方法来提高作物中RS含量。

水稻中RS的含量受多种因素的影响,包括直链淀粉含量、淀粉的链结构、颗粒大小、无定形含量等分子特征。这些特性是由遗传因素决定的,如淀粉生物合成途径中涉及的基因和转录因子。水稻淀粉的生物合成又是一个复杂的过程,也会涉及不同的酶的作用。大量研究表明,RS含量与直链淀粉含量密切相关,两者都是由参与淀粉生物合成途径的基因决定的。研究发现,下调SBEII基因可显著提高直链淀粉和RS含量。

2024年8月,四川农业大学陈晓琼教授团队在Frontiers in Plant Science发表题目为“Triple gene mutations boost amylose and resistant starch content in rice: insights from sbe2b/sbe1/OE-Wxa mutants”的研究论文,通过用she2b突变体敲低IR36ae中的SBEI (Os06g0726400)表达,并分别在IR36ae和RNAi SBEI中过表达Wxa (Os06g0133000),确定三个特定基因突变对RS形成的影响,同时进行了农艺性状分析,测定了直链淀粉和RS含量,分析了淀粉分子特征,并检测了淀粉生物合成途径相关基因的表达,为培育高RS含量的品种提供有用的信息。

研究材料

野生型IR36,IR36ae(单突变体)

技术方法

载体构建和转化,qPCR,直链淀粉、抗性淀粉检测、淀粉粘度、膨胀力和水溶性、淀粉电镜、淀粉分子量、淀粉粒度以及淀粉链长分布
研究结果


1. 淀粉生物合成途径相关基因的突变体构建及表达水平检测

通过测序鉴定出带有sbe2b的IR36ae突变体(补充图1A)。成功生成了sbe2b/RNAi-sbe1双突变体和sbe2b/RNAi-sbe1/OE-Wxa三突变体。同时还鉴定了RNAi-sbe1和OE-Wxa (补充图1B, C)。

补充图1. A.WT和单突变体中sbe2b的序列; B.WT和双突变体中sbe1的胶带; C.WT和三突变中Wxa的胶条

与野生型相比,双突变体和三突变体中ISA3(开花5天后)的表达水平分别高出5倍和11倍。本研究进一步发现,sbe2b活性缺失和sbe1表达抑制对SSIIaSSIIIa的表达有显著影响。而ISA3AGPSIIbWxa的表达明显增加。单突变体开花10 d后Wxa和普鲁兰酶的表达量分别高出5倍和9倍以上。这表明突变的sbe2b和RNAisbe1影响了其他与淀粉生物合成途径相关的基因的表达。

图1. 淀粉生物合成途径下颖果的基因表达水平。(A)开花后5 d的基因表达;(B)开花后10天的基因表达


2. 直链淀粉和RS含量随突变基因数量的增加而显著增加

由于直链淀粉含量受包括农艺性状在内的多种因素的影响,作者连续记录了3年的农艺性状。结果表明,野生型结实率最高,其次是单突变体和三突变体。双突变体对结实率和千粒重的影响显著,导致产量显著下降(图2A-D)。而三突变体对千粒重和结实率的恢复与单突变体相当。这表明OE-Wxa对产量的恢复有一定的作用。同时,连续3年分析直链淀粉和RS含量。三突变体三年内直链淀粉含量最高,其次是双突变体和单突变体,野生型含量最低(图2E、F)。这表明直链淀粉和RS含量随着突变基因数量的增加而显著增加。

图2. 野生型和3个突变体的表型、种子清净率、千粒重、直链淀粉和抗性淀粉含量


3. 随着突变基因数量的增加,RVA特性逐渐降低

RVA光谱分析表明,除峰值温度(PT)外,其余指标均呈下降趋势。例如,野生型的崩解粘度分别是单突变、双突变和三突变的4倍、7倍和41倍(图3)。这表明sbe1sbe2bWxa都对RVA特性有显著影响,随着突变基因数量的增加,其影响逐渐减弱。

图3. 野生和三个突变体样品的粘度结果

4. 基因SBEIIb和Wxa对溶胀力的影响

胶稠度最高的是三突变体,其次是野生型、双突变体和单突变体 (表1)。水溶性最高的是双突变体,其次是单突变体。然而,与凝胶稠度和水溶性相比,膨胀力表现出不同的模式。以野生型最高,其次为双突变、单突变和三突变。说明SBEIIbWxa基因显著影响溶胀力。

表1. 野生型和三个突变体的GC、水溶性和溶胀力

5. 基因突变对淀粉形态的改变

随着突变基因数量的增加,透明度逐渐降低。三突变体透明度最低,而野生型透明度较高(图4A-D)。其次从横截面角度来说,野生型的淀粉颗粒形态为结晶状且紧密间隔,而单、双、三突变体的淀粉颗粒更圆、更松散(图4f - 1)。进一步观察颗粒形态,证实晶体结构仅存在于野生型中,而所有三种突变体均表现出更圆和更松散的颗粒(图4J-M)。淀粉颗粒大小为单突变体>三突变体>野生型>双突变体。

此外,在野生型和双突变体之间,淀粉颗粒大小没有显著差异(图5)。这些发现表明基因SBE1SBEIIbWxa都在调节淀粉颗粒形态中发挥作用。

图4. 野生型和三个突变体的种子和胚乳形态

图5. 野生型、单突变体、双突变体和三突变体籽粒中提取淀粉的粒度

6. 基因突变对淀粉精细结构的改变

单突变体的数量、平均分子量(Mn)和平均分子量(Mz)均显著降低。这些值比野生型低两倍以上。同时,Mw/Mn和Mz/Mn在野生型中明显低于单、双和三突变体。(表2)

SBEIIb在水稻胚乳支链淀粉簇晶片分支的形成中起特殊作用,并影响支链淀粉链长分布。本研究发现,单突变体she2b显著减少了A链(DP≤12)和B1链(13≤DP≤24),与野生型相比分别减少了19%和6%。

与野生型相野生型的17°峰值最高,其次是单突变体和三突变体。相比之下,单突变体的峰值最高(18°),其次是双突变体和三突变体比,Sbe2b显著增加了B2、B3链及长链部分。

分支度在单突变体中最低(1.66%),而野生型、双突变体和三突变体之间差异极小,这与结晶度相似(图6E)。这说明sbe2b对分支度的影响较大,而sbe1则有助于恢复由于sbe1突变而导致的分支度降低。

表2.野生型和三种突变体的分子量分布

图6. 野生型和三个突变体淀粉颗粒的淀粉链长和x射线衍射(XRD)图谱

小结

研究表明,三突变体的直链淀粉和RS含量最高,其次是双突变体和单突变体,而野生型的含量最低。此外,在三突变体中过表达Wxa显著提高了结实率和千粒重。

这些结果表明,突变基因数量的增加可以进一步提高RS含量。这为通过对淀粉生物合成相关基因进行基因编辑来提高RS含量提供了有价值的见解。为尽快选育高RS含量和有利农艺性状的水稻品种提供了有价值的信息。





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排版:野凌

审核:三黍生物企宣部

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