不同物质结构、携带的基团不同,质谱检测过程中,物质的离子化效率、对仪器信号的响应等方面可能存在较大差异,结果就呈现出不同物质的质谱检测效率不一致。因此,代谢组数据仅适用于不同组别间同一物质的比较,不适用于同一样本内部比较不同物质的差异。
在检测两种物质的丰度水平时,代谢组学获得的两种物质丰度比值关系和其他技术的检测结果明显相反,这是什么原因?
代谢物种类繁多,为何只能鉴定到几百到上千个物质?
由于代谢物分子量小,结构复杂,只通过分子量和电荷数(一级质谱)鉴定不是很准确,因此更依赖标准品二级谱图数据库,但很多公共数据库(HMDB、Metlin等)中约有90%的已知代谢物都没有标准的二级谱图。即使有二级信息,由于代谢物的离子谱图可能由不同实验室的不同质谱仪器打出,仪器的种类、参数设置不同,都可能导致同一个代谢物产生的谱图存在偏差。因此代谢物虽然种类多数量多,但是鉴定到的物质相对较少
非靶向代谢物定性定量原理是什么?
定性原理:主要根据样品打到的谱图和数据库谱图进行匹配,GC-MS综合保留时间、保留指数、谱图进行鉴定;LC-MS综合分子量、质荷比(m/z)、保留时间(RT)、谱图等信息进行代谢物鉴定。目前常见的GC-MS非靶数据库有NIST,GMD,weily、公司自建库等,常见的LC-MS非靶数据库有HMDB、 Metlin、MassBank、MzCloud、Lipidmaps、KEGG、CHEBI、公司自建库等。定量原理:质谱检测获得的原始数据经过峰识别(peaksidentification)、峰过滤(peaks filtration)、峰对齐(peaks alignment)等处理,获得含质荷比(mass to chargeratio, m/z)、保留时间(retention time, rt)、峰面积(intensity)等信息的数据矩阵。峰面积是代谢物的质谱响应强度,表征代谢物的丰度。对峰面积进行归一化后,可用于后续差异代谢物筛选分析
分离纯化中,离子上柱的母液浓度是多少?
离子纯化母液浓度一般是10-20mg/ml,根据样品状态会有调整
粗多糖中的主要杂质有?
蛋白质、色素、脂肪和酚类等物质(淀粉/果胶/纤维素等)