横线代表这个组的平均值
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靶向结果里,代谢物柱状图里面有一道横线,代表什么意思?
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非靶代谢怎么为什么不能做两组之间的韦恩图?
因为非靶代谢在搜库时,是所有样本合并在一起搜库,因此如果在A样本中鉴定到了某物质,但在B样本没有对应的出峰,会认定这个物质只是在B样本里含量低而不是没有,做韦恩图是为了区分共有和特有代谢物。
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客户在别的地方测得非靶数据,其中关注的大部分物质在我们公司都没有检测到,原因是?
1、需要在数据库中检索是否存在客户关注的物质,没有的话自然是检测不到;2、代谢物在样本中的含量过低,没有办法检测到;3、非靶代谢的目的是广泛的去检测样本中的代谢物,可能代谢物提取前处理方法不适应于客户关注的物质;4、搜库过程中,得分值过低的物质被过滤掉了;5、不同的检测方法、仪器、使用的数据库都是造成检测结果的差异,属于正常现象。
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转录组里面只有FPKM值的PCA图,图片较少,有什么解决办法吗?
可以走售后做PLADA,OPLSDA分析图,也可以用TPM值去做PCA,PCOA,OPLSDA,PLSDA图。
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PPI网络互作图可以把基因ID换成基因名称去作图吗?
首先要看总表里面有没有基因对应的基因名称,有的话就可以做,没有就不行。